V případě, že migrujete systém Moodle mezi různými doménami nebo ze subdomény na doménu, je zapotřebí provést kromě přesunutí adresářů a databází ještě tyto dva kroky:
1) Upravit konfigurační soubor
V souboru config.php je zapotřebí pozměnit hodnotu $CFG->wwwroot
dle nové cesty.
2) Změnit URL
Dále je zapotřebí změnit URL systému Moodle – toto lze provést prostřednictvím nástroje replace.php, který můžete naleznout na cestě mojedomena.cz/admin/tool/replace/index.php či ve starších verzích na adrese mojedomena.cz/admin/replace.php – tento nástroj dokáže v databázi vyhledat řetězce a nahradit je, proto se ho hodí využít právě při provádění migrace.